15 липня 2006 року за ініціативою тренерів школи «Атлет» було прийнято рішення про створення Футбольного клубу «Атлет». Першим президентом було обрано – Мухіна Ігоря Миколайовича, а в січні 2007 року на посаду президента був обраний – Старовойт Олександр Сергійович.
Основною метою створення клубу вбачалось в можливості надання випускникам ДЮСШ «Атлет» продовжувати вдосконалювати свою професійну майстерність та займатися улюбленою справою і надалі після завершення спортивної школи.
За період функціонування футбольного клубу «Атлет» – команда дорослих вийшла з першої ліги першості до вищої ліги. Являється одним з лідерів київського футболу.
Літопис досягнень нашого клубу:
2006 р. – 2-е місце в першості м.Києва (перша ліга). В стикових матчах за право виходу до вищої ліги наша команда не змогла здолати ФК “Артіст” двічі зігравши в нічию 1-1 (вдома) та 0-0 (на виїзді).
2007 р. – 1-е місце в першості м.Києва (перша ліга), фіналіст Кубку м.Києва
2008 р. – 2-е місце в чемпіонаті м.Києва (вища ліга), перший володар Кубку В.Мунтяна
2009 р. – 4-е місце в чемпіонаті м.Києва (вища ліга)
2010 р. – 4-е місце в чемпіонаті м.Києва (вища ліга), володар Кубку В.Мунтяна
2011 р. – 3-є місце в чемпіонаті м.Києва (вища ліга), володар Кубку В.Мунтяна
2012 р. – 10-е місце та перехід до першої ліги м.Києва
2013 р. – 2-е місце в першості м.Києва (перша ліга) та повернення до вищої ліги м.Києва
2014 р. – 3-е місце в чемпіонаті м.Києва
2015 р. – 4-е місце в чемпіонаті м.Києва
2016 р.- 4-е місце в чемпіонаті м.Києва, півфіналіст Кубку м.Києва
2017 р. – 4-е місце в чемпіонаті м.Києва (скорочений)
2017/2018 р. – 2-е місце в чемпіонаті м.Києва, півфіналіст Кубку м.Києва
2018/2019 р. – 2-е місце в чемпіонаті м.Києва, півфіналіст Кубку м.Києва, учасник Кубку України серед аматорів (попередній етап)
2019/2020 р. – учасник чемпіонату України серед аматорських команд